De combinatie John Lennon en Jezus stond een aantal keren garant voor controverse. De eerste keer gebeurde dat in 1966 toen Lennon opmerkte: "Het christendom zal krimpen en verdwijnen. Daar hoef ik niet over te discussiëren. Wij zijn populairder dan Jezus op dit moment. ". In Amerika werd deze opmerking niet bepaald enthousiast ontvangen, hoewel Lennon niet gek ver naast de waarheid zat. In het zuiden van de Verenigde Staten werden massaal Beatlesplaten verbrand en de Ku Klux Klan dreigde Lennon te vermoorden. Lennon moest publiekelijk door het stof kruipen om zijn excuses aan te bieden.
Je zou denken dat Lennon wat voorzichtiger zou worden, maar in 1967, toen alle Beatles personen voor op de hoes van Pepper's mochten aandragen kwam Lennon met Jezus en Hitler. Jezus kwam bij voorbaat al niet bij de platenmaatschappij niet door de censuur. Een foto van Hitler stond wel klaar voor de hoes maar werd op het allerlaatste moment niet in de collage opgenomen (net als Ghandi overigens, maar uiteraard om andere redenen).
En dat terwijl ze Jezus om toestemming hadden kunnen vragen want op de avond dat de band Fixing a Hole opnam belde er iemand aan bij McCartney, die vertelde dat hij Jezus Christus was. McCartney, die naar eigen zeggen niet het risico wilde lopen de Messias te schofferen als ie de waarheid sprak liet hem binnen voor een kop thee en nam hem mee naar de sessies op voorwaarde dat hij stil in een hoekje zou blijven zitten. McCartney voegde er later droog aan toe dat hij daarna nooit meer iets van hem had vernomen.
In 1969 namen Lennon en McCartney met z'n tweeën het nummer The Ballad of John and Yoko op en daarop zong Lennon veelvuldig Christ, you know it easy, zonder dat het al te veel aanstoot gaf. Met uitzondering dan van Nieuw Zeeland waar het woord keurig iedere keer weggepoetst is in de mix.